《仙剑奇侠传2000》是仙剑奇侠传1的一个加强修正版,本作优化了一些画面效果,而且增加了一些支线剧情,2000里面的迷官变得更复杂了,玩家需要花费更多精力来通过,最为显著的区别就是仙剑奇侠传2000一共有3个结局,一个和98版一样的正常结局,一个月如结局还有一个灵儿结局,相比起98柔情版,游戏的自由度大大增强了。不过罗卜青菜各有所爱,有一部分玩家还是认为98版比较经典。
主角李逍遥是一个平凡的年轻人,他一心习武,梦想名震江湖,在机缘巧合下结识神秘少女赵灵儿,而展开护卫佳人千里寻母的旅程。途中因为多管閒事,得罪了欢喜冤家林月如,后又被苗族巫女阿奴死缠不放。面对蕙质兰心的赵灵儿、外刚内柔的林月如、烂漫天真的阿奴,他将要如何抉择呢?而这样的角色组合又将产生多少惊险刺激,与悲欢离合的动人故事?