《边境之地AG5》讲述的是在公元2500年,在地球爆发了全面性的核战。文明和科技极近毁灭,只有少数几个特区还保有原先的科技和绿地。然而这时,新诺亚帝国的统治者摩撒假“拯救最后地球”之名,开始对地球“特区联邦政府”展开大规模侵略行动。其中以“AG-5特攻小组”所捍卫的“边境之地”战况最为激烈。
“AG-5特攻小组”是由一群英勇可爱的美少女战士所组成。玩家在《边境之地AG5》中担任“AG-5特攻小组”的指挥官,带领著“AG-5特攻小组”抵御“新诺亚帝国”的侵略。在这群英勇的美少女战士里,各个均怀有独特的能力,所驾驶的机甲战士也各有其特色。每一关任务简报后,玩家可以从众多的美少女队员中选择所将执行任务的角色,当然也可以根据任务的提示选择适当能力的角色,并且为其所驾驶的机甲更换各式各样先进的武器,进行机甲火力上的调配,来顺利达成上级所赋予的任务。