《杀出重围:堕落》的故事背景设定在《杀出重围:人类革命》的同一年中,具体时间则是莎瑞夫工业遭受攻击之后,不过 Adam Jensen 并没有出现在该游戏当中,这不免让一些《杀出重围》的忠实粉丝有些失望。此外本作是基于小说《杀出重围:伊卡洛斯效应》(Deus Ex novel Icarus Effect)进行改编,两款作品的世界观和主角(男主角Ben Saxon 和女主角Anna Kelso)也完全一致,游戏的剧情将紧接着小说结尾展开并进行补完,在游戏中男主角 Saxon 一路上将会遇到遭受排斥反应抑制药剂(neuropozyne)感染的生化敌人,除了与之展开激战外,揭开隐藏在药剂事件背后的真相则更为重要。