《轩辕剑3外传天之痕续传轩辕劫》的故事发生在“天之痕”的三年后。主角陈靖仇和拓拔玉儿从通天塔回来之后守护着化为女娲石的小雪和已故师父的衣冠冢。但是有一天，他们遇到了新的神秘敌人——轩辕神族。轩辕神族不仅打败了陈靖仇和玉儿，更把轩辕剑和女娲石夺走。并声称包括其他的上古神器在内本都是属于他们的东西。于是，为了救回小雪，也为了阻止轩辕族的企图。陈靖仇与玉儿展开了旅程。
在旅途中，主角意外地救下了一名长得和小雪一模一样的女孩。可是她却坚持声称自己不是小雪……
那么，这名女孩与小雪到底有没有关系，她和陈靖仇、玉儿之间又会发生什么故事？神秘而强大的轩辕神族，他们的最终目的又是什么呢？
《轩辕剑3外传天之痕续传轩辕劫》 系统特色：
1、合成系统
游戏中的高级装备，终极兵器都需要靠特殊的材料来合成。但是这些原材料本身就是具有特殊强化效果的高级稀有物品。那么是合成强力武器还是使用这些高级物品来强化自身就看玩家的选择了。
2、魂炼系统
游戏中的每一种敌人和怪物都具有一种特殊的、主角们所没有的能力。在战斗中使用“魂炼”指令可以将他们收服。之后把这些妖怪的魂魄装备在身上就能学到这些敌人的能力和技巧了。有些敌人（比如孙悟空）不仅拥有多种特殊技能，还能同时增强主角的各项属性，是很珍贵的魂魄。
3、战斗系统
战斗系统使用的是RTAB横版，虽然没有镜头移动，但丰富的战斗特效应该还是可以满足各位玩家的视觉需求。战斗中有些武器具有特殊的效果，比如莫邪剑，可以将对敌伤害的50%转化为自己的生命力；金箍棒，在伤害敌人的同时还能造成混乱效果等。
4、法宝
《轩辕剑3外传天之痕续传轩辕劫》 中会有各种各样的隐藏法宝出现。只是这些法宝所在的位置十分隐蔽。需要玩家好好摸索才能发现。但是一旦装备上这些法宝就可以为战斗带来更多新奇的体验。比如“鼠槌”这个法宝。可以在一定时间内无视属性地攻击所有敌人。只要连按确定键就可以对敌人造成一次伤害，按得越多伤害越多。虽然初期的攻击力比较低，但随着使用熟练度的增加，每次的伤害也会增加。
轩辕剑3外传天之痕续传轩辕劫—
轩辕剑3——大马士革周边任务和
圣斗士星矢
王国陷落
RIVE
突袭4
苍翼默示录
蒸汽：致富之
过气英雄
虫姬
额滴土豆！我