在大蛇封印解除成功的状况下，迷之组织的一员“无界”趁混乱夺取了八神族的力量，上一届kof大会因主持者神乐千鹤负伤而在混乱中闭幕……随着季节的变迁，时间的推移，今年的格斗大会开始了。然而华丽的kof大会只是一个表面，背面却充满了种种复杂的阴谋。夺走解除封印后大蛇的力量的神秘组织将会有什么样的目的？缺了一部分的三神器能否扭转逆势？一切尽在《拳皇12》！
本作除了原创新角色外，以往的人气角色如月影二等也将回归，原有的角色部分招式也会有所改变，采用了新基板后招式都会变得更加华丽，原有的火焰场面将会以半透明效果表现，另外本作采用了“即时换人”系统，也就是说玩家可以随时切换出场人物，而且增加了在遭受攻击的时候也可以强制逃出的saving-shift功能，队长更具备dreamcancel能力，可算是《拳皇》系列的革命！
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