《姜太公的小岛》的故事发生在元末,爱国人士男主角听到倭寇正在侵犯中华领土——“姜太公小岛”,高喊“国家兴亡,匹夫有责”来到小岛打击倭寇。在抗击倭寇的战斗中,遇到了正义凛然的英雄常遇春和有情有义的神秘女子“鞭子姐”。
《姜太公的小岛》的世界观基本与武侠相同,加入了一些神话色彩,将中国四大神兽化为人形,使之成为推动游戏故事情节发展的重要元素。游戏的过程中,玩家将会与四大神兽作战、交流,从而逐渐理解他们内心隐藏着的想法……
《姜太公的小岛》的结局自然是赶走了倭寇,成功保卫了小岛。然而,一切的一切,却没有那么简单。为什么倭寇不惜血本要攻下荒芜的小岛?目的是什么?自远古起就居住在大陆的四神兽为何心灰意冷来到小岛?十二岁的萝莉为何甘愿同机械师一起叛为汉奸?保岛归来后,剑圣的守护之剑竟然挥向了……?
《姜太公的小岛》表面看充满激情,实际故事中充满了小人物逐渐发现自己无法改变世界的无奈感。